海洋港口学院的前身是连云港教育学院的物理科、化学科和生物科。学院自1978年起招收专科学生；于2000年、2003年分别与江苏师范大学、淮阴师范学院联合招收物理专业本科生；2011年招收机械设计制造及自动化、生物科学专业本科生；2012年招收生物技术专业本科生；2013年招收制药工程专业（江苏师范大学连云港校区）本科生。2020年，学院继续与南京晓庄学院共同培养“3+2” 分段本科，同时增设与盐城师范学院合作的生物制药技术“3+2”专业，自2020年暑期开始招生。学院现有6个专科专业，其中应用电子技术专业为校级特色专业、“3+2”分段培养试点专业，并获得中央财政扶持（2011年）；生物制药技术为“3+2”分段培养试点专业；生物制药技术专业和药品生产技术专业为校品牌专业。学院与江苏康缘药业股份有限公司、江苏豪森药业股份有限公司、连云港康缘医药商业有限公司、连云港伍江数码科技有限公司等企业联合培养学生，在连云港杰瑞电子有限公司、常茂生物化学工程股份有限公司、江苏诺泰制药有限公司建有顶岗实习基地，能满足学生实习和就业的需求。
学院秉持“诚信修德，严谨笃学”的育人理念，严格管理，精心施教，形成了良好的院风、教风和学风。学院还曾经有过多年的本科办学经验。近三年来，专科毕业生“双证率”为100%，2022年专转本录取率超过20%。
学院狠抓日常管理，努力促进学生德智体美全面发展。学院开展以“爱心家教”为代表的志愿者服务活动，定期组织学生前往花果山乡前进村、市残疾人康复中心、市福利院、敬老院开展志愿者服务活动，在实践活动中引导学生关爱农村留守儿童、残疾人、孤寡老人等社会弱势群体，教育学生以实际行动弘扬社会主义核心价值观。近三年，学院学生“友缘”太极拳队获全国比赛冠军3项，省、市比赛冠军多项；有2个班级获得省“先进班集体”荣誉称号；学生有3人被评为江苏省优秀学生干部，1人被评为省三好学生，2人获得连云港市“雷锋志愿者先进个人”称号。在校运动会上，学生连续多年获团体总分、男子团体、女子团体总分第一名。学院学生党支部荣获“江苏省高校先进基层党组织”称号。
学院现有教职工43人。其中教授15人；博士（含在读）10人；全国优秀教师1人，江苏省高等学校教学名师1人，省优秀教育工作者1人，江苏高校优秀共产党员1人；省“333工程”培养对象6人、省高校“青蓝工程”中青年学术带头人4人、优秀骨干教师5人、省六大人才高峰1人；享受市政府特殊津贴2人。学院荣获“江苏省优秀教师群体”荣誉称号，生物制药技术教研室荣获连云港市“工人先锋号”荣誉称号。学院教师刻苦钻研教学，在省信息化教学比赛中获一、二、三等奖各1项，参加省微课竞赛获二等奖、三等奖各1项；学生获省本专科优秀毕业论文一等奖3项、二等奖4项。近五年，教师发表论文400多篇，被SCI、EI收录30余篇（其中，SCI一、二区高质量文章多篇）；出版教材7部；获批专利30多项。学院科研成果在全校名列第一。
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